扎什伦布寺内建有灵塔，塔内藏有一世达赖根敦朱巴(1391—1474)的遗体和历代班禅涅磐以后的遗身。其中，四世班禅罗桑曲吉坚参(1567—1662)的灵塔最为豪华。 建这座灵塔殿堂，用了4年多时间，在公元1666年修成，塔身高11米，花费了黄金2700余两，银子33000多两，铜78000多斤，绸缎9000余尺，还有珊瑚、珍珠、玛瑙、松耳石等共7,000多颗。

　　灵塔这种建筑，与佛教的创始人释迦牟尼有关。据传说，2500年前，释迦牟尼圆寂后，他的遗体由弟子火化，其舍利被摩揭陀（古印度的奴隶制国家，佛教圣地）等8国的人们分别迎去，建塔供奉。这就是世界上第一批灵塔，从那以后，佛门弟子为了纪念、供奉高僧，通常在他们圆寂后也为其建筑灵塔。后来逐渐成为一种习俗。这种习俗也传到了西藏。所不同的是印度的灵塔里多是火化后的舍利，而西藏的灵塔里大多是高僧的遗体。8世纪后期，在桑耶寺旁的黑布山脚下，为印度高僧寂护大师修建了灵塔，这是西藏历史上第一座灵塔。后来历世达赖、班禅的遗体均采用这种葬法。这种灵塔，藏语叫“色束”，即黄金树。布达拉宫内保存有这类灵塔8座。扎什伦布寺原有一世达赖和历世班禅的灵塔，在“文化大革命”中，五至九世班禅5座灵塔遭到破坏，1980年以后重建五至九世班禅合葬灵塔。

　　这座班禅“东陵札什南捷”大殿包括灵塔和灵塔殿两部分，塔建在殿内，坐落在日喀则的扎什伦布寺东侧。

　　这座宽敞明亮、富丽堂皇的灵塔殿总建筑面积1933平方米，高33.17米。整座建筑既突出西藏古代宗教建筑风格，又吸收唐、清两代内地寺院建筑艺术特色。建筑材料既有钢筋、水泥，又有西藏木石结构的建材，既体现了古老的宗教建筑艺术，又融入了现代建筑方法。灵塔殿墙全部用花岗石砌筑，厚达1.80米。殿内外安装了现代化的灯具。

　　灵塔由紫红色和棕色两大建筑部分组成，在殿的顶端，覆盖着金顶，金顶四角嵌装有6个鳄头、兽吻飞檐。还有一排金色的经幢，金光闪闪。殿门正中安放着高11.52米的灵塔。塔身以银皮包裹，遍镶珠宝。仅包银塔，就耗费白银3338斤，黄金217.77斤，水银1330斤，黄铜11277.5斤。信教群众在“文革”中冒着生命危险保存下来的五至九世班禅遗体残骸归还寺庙后，分装在5个檀香木匣内，安放在塔的壶瓶里。塔内还存放有袈裟、大藏经、历代班禅的著作、各教派大师的经典以及各种金银制成的宗教用品，各种粮食、糖果、水果、茶叶、酥油等供品。灵塔正中安放着九世班禅却吉尼玛的铜像。大殿北壁绘有佛祖释迦牟尼和他两位上首弟子的画像，黄教创始人宗喀巴和他的两位上首弟子的画像。还给有后弘时期赴藏宏法的印度高僧、“噶当”派祖师阿底夏及其两位弟子的一组壁画。大殿西侧，绘有九世班禅的画像、印度佛教高僧寂护大师、宁玛派创始人莲花生和藏王赤松德赞的画像。大殿东侧，正中绘有十世班禅额尔德尼·确吉坚赞大师的画像。

　　为重建这座灵塔，国家拨出专款600万元，西藏自治区拨出专款70万元，扎什伦布寺自筹资金100万元。十世班禅大师生前主持东陵扎什南捷大殿的开光典礼。