当代有些科学工作者对瑜伽、禅定的研究表明：在超觉静坐、禅定中，具有组织新功能态能力的额叶脑电波随功夫的深入而趋向高度有序化，通常状态下主要在大脑皮层枕区的阿尔法波转向额区，通常状态下的左脑优势转向右脑优势，非对称结构转向镶嵌交叉的对称图像，从丘脑下部到听觉皮层的广大脑区域均处于不同程度的抑制状态，大脑功能从总体上看来与睡眠、清醒时皆不同，处于一种全脑共振状态、特殊兴奋状态，给提高智能提供了生理基础。
　　当代西方心理学家通过大量研究，发现就人的心理素质而言，情绪商数(情商，EQ)比智商更为重要，可能是一个人成功生活的最佳预言者，在更大程度上决定了一个人的婚姻、工作和整个人际关系的处理，甚至影响着其事业的成功与否，甚至还决定了一个国家、一个社会和一个企业的命运。所谓情商，指一个人对自己情绪的理解及控制自己情绪、承受外界压力、把握自己心理平衡、与他人建立良好关系的能力(社会智力)。因而从儿童期便注意培养情商，通过各种心理锻炼方法提高情商，受到人们的重视。
　　这种‘情商’的培育和提高，早就为佛教所重视，佛陀‘自治其心’、‘自净其意’之道，其实便可看作一种情绪管理学，禅定便是其培养管理的重要方法之一。佛学说经过禅定锻炼的心有很强的‘堪能性’(自我控制、承担事业的能力)，《大智度论》比喻说，未经禅定锻炼的散心如未加鞣制的生牛皮，堪能性很低，不堪制作衣物，定心则如经过鞣制的熟牛皮，可用来任意制作衣物。佛教诸乘经论中一致说，世间三昧(四禅八定)能伏(制服)欲界烦恼，止息贪嗔嫉慢的躁动，使低沉、忧伤、焦虑、紧张等有损健康的不良情绪自然不起，即便生起也容易制伏，从而令人心理安恬平静，行为符合社会道德规范，具有很强的自我约束、自我平衡心理的能力。《小止观》卷下说，初修禅定，可能发生内外善根发相，使宿世的善根种子成为现行，优化或改变心理素质，使私心淡薄，慈悲心、孝顺心、恭敬三宝心、谦卑心、精进心、惭愧心等善心自然增长，乐于持戒布施、改过迁善，热心助人，人格、气质、行为模式都会发生良性变化。《瑜伽师地论》说，修习禅定，至得奢摩他发身心轻安，‘能障乐断诸烦恼品，心粗重性，皆得灭除，能对治彼，心调柔性、心轻安性，皆得生起’【《瑜伽师地论》卷三二，《大正藏》卷三十，464c。】。谓奢摩他定心若保持不失，能克服对治烦恼的心理障碍，使心易于调制，轻快柔和，大大增强制伏烦恼和排除不良情绪的能力。若进一步修习观(毗婆舍那)，得出世间三昧，自宰其心、净化自心的力量更为强大，可以从根源上完全断灭或转化烦恼，将凡夫有漏的、不自在的心理结构改造为圣者清净的、自在的超常心理结构。

　　四、禅定中的病态心理

　　修习禅定进程中，既可能产生益智开慧、优化心理结构的良好心理效应，也可能发生心理失衡、烦恼增盛、精神错乱等有害的副作用，导致心理、精神上的种种弊病。《文殊问菩提经》云：‘禅定有三十六垢。’【转引自《摩诃止观》卷十七，《大正藏》卷四六，117b。】垢，指障碍、弊病，包括有害的副作用。禅定的负面效应，大多是因不善如法调摄自心、不理解禅定中的身心变化并对正确处理方法无知而造成的。对禅定中心理的种种不良变化、变化的机理和处理法则，佛教有详悉的论述，列举了多种治疗精神性禅病的方法。
　　佛典中所说禅定中可能导致的病态心理，主要有以下几种：
　　1. 烦恼妄念增盛。禅定尤其是以佛法智慧为导的出世间止观，具有伏断烦恼的作用，伏断烦恼，也是佛教教人修习禅定的主要目的所在。但在修习过程中，特别是初修者中，烦恼、妄念、邪见反而比不修禅定时增盛，乃至不堪制伏的情况，也非罕见，甚至有因此造作恶业、违法乱纪者。这种情况，在禅籍中不乏说明解释。《小止观》卷下将这种现象称为‘烦恼发相’，有性欲亢进、脾气变大、嗔怒异常、吝啬小气、嫉妒心强、坚执邪见、个人野心膨胀等表现，与所修的禅观往往相关。此乃阿赖耶识中所藏宿世的烦恼种子在止念澄心的过程中，浮现于意识层面，或被修行逼现于意识层面，不自觉地、往往是无缘由地滋生种种烦恼，或稍起联想即生烦恼，或妄念、杂念泉涌，难以遏止，严重干扰修定，甚至导致心理失衡，精神失常，酿成杀害、淫乱、诈骗、偷盗等恶业，称‘恶业发相’。《大乘要道密集.道果延晖集》从气脉的角度解释密乘禅定修习中烦恼妄念增盛的现象，认为由于观想心间咒字等，身中之气集中于心脏部位，令人‘无由自生种种烦恼’，修习至此，称‘自生烦恼定’。继而，因气进入并充满左右二脉，精血增盛，提供了滋生妄念烦恼的生理基础，从而不假于境，也会自然生起种种妄念，称‘自生妄念定’。这可谓修习禅定进程中最艰险的一段路程，正确处理，过此阶段，则烦恼妄念自会被降伏。从现代心理学看，佛教禅修者大多出家禁欲，在尚未证得堪以转化性能量的初禅以上正定时，只能以持戒压抑凡人与生俱来的性欲等人欲，再加上随修定聚气而来的生命能量(精气血)的增长，人欲自然会比不修定时或比不修定者更大，甚而会导致性心理变态及整体的心理失衡，心理承受力太弱者则可能导致精神病。在弗洛伊德看来，压抑本能的性欲，害处极大，是许多精神病和犯罪的根源，这是有一定道理的。佛教禅定处理此类问题，主要用修不净观、慈悲观等相应的禅观和般若空观予以对治，再加上守护根门、初夜后夜精勤坐禅经行、修气脉明点等方法，若修习者具备正见、善知识、有闲等条件，自不难度过这一难关。若修习者不具足获得正定所需的诸条件，则往往难过此关，可能长期被增盛的烦恼妄念所恼而不得安宁，甚至导致精神病。大概出于这种考虑，佛陀不教在家弟子持不淫戒禁欲而仅戒邪淫，也很少教在家弟子修不净观及四禅八定，《优婆塞戒经·禅波罗品》教导居家大乘佛教徒修习的，主要是在生活中随时观察、把握自心的禅定。
　　2. 厌世及难以入世。观察世间苦空无常，人身不净，以期超出世间，是佛教禅定尤其是小乘禅的突出特质。就其超出生死轮回的宗教趋求而言，佛教禅可谓效果昭著。但修习佛教禅尤其小乘禅，若把握不当，也可能使人消极厌世，一味遁入自己的精神世界，与世俗社会和其他人格格不入，对现实看不惯，失去社会责任心，难以与社会合拍，难以与普通人和谐相处，丧失在社会中生存的能力，导致家庭关系、人际关系紧张，可能因此使自己心理失衡，性格乖僻，甚而以自杀了结。《杂阿含经》卷十三富楼那禀告佛：有佛弟子因厌患身体，‘或以刀自杀，或服毒药，或以绳自系，或投深坑’【《大正藏》卷二，89c。】。同经卷二九载：佛住金刚聚落跋求摩河侧萨罗梨林中，诸比丘修不净观后，极厌患身体，以各种方法自杀，或请求别人杀死自己，有一外道鹿林梵志子受魔所惑，持刀杀死自愿一死而得解脱的比丘六十人。佛从定出，知道此事，乃教众比丘修没有厌世自杀副作用的数息观和十六特胜观。又如南传佛教禅法中的食厌想，修习不当可能伤胃厌食，损伤身体。当代美国人杰克.康菲尔德(Jack Kornfield)于1967年赴泰国巴蓬寺随阿姜查(Ajahn Chah)学习南传佛教传统的内观禅五年，对自己的定境和内观能力感到某种程度的满意，自己觉得能止息烦恼，但当他离开共修环境而回到美国后，却发现自己对人际关系怀有莫大的恐惧心理，用学得的定慧双修方法也未能得到改善。这种情况，在今日的不少佛教徒中大概都有不同程度的同感。佛教对此并不乏对治之道，如修十六特胜观、佛身观等，观想悦意境物，就有对治修不净观引起之弊端的特效。修四无量心观和大乘的菩提心、禅宗之禅、密乘的本尊法等，为对治厌世病的良药。大乘世间、出世间不二，‘佛法在世间’的思想，及在社会生活中力修六度四摄的积极精神，尤其是当今佛教界弘扬的人间佛教，提供了针治禅修者难以入世的良方。