南无毗卢遮那佛　
南无本师释造牟尼佛　
南无药师琉璃光如来　
南无无量寿佛　
南无尽十方遍法界过去一切诸佛　
南无尽十方遍法界现在一切诸佛　
南无尽十方遍法界未来一切诸佛　
南无药师琉璃光如来本愿功德经　
南无日光遍照菩萨　
南无月光遍照菩萨　
南无文殊师利菩萨　
南无观世音菩萨　
南无得大势菩萨　
南无无尽意菩萨　
南无宝昙华菩萨　
南无药王菩萨　
南无药上菩萨　
南无弥勒菩萨　
南无消灾障菩萨
南无增福寿菩萨　
南无乐音树下三万六千菩萨　
南无阿难尊者八千比丘诸大圣僧 　
南无救脱菩萨

礼诸佛已，次复忏悔。若有众生欲脱病苦。当为其人，七日七夜受持八分斋戒。应以饮食及余资具。随力所办供养苾刍(上廾下刍)僧。昼夜六时礼拜行道。供养彼世尊药师琉璃光如来。读诵尊经四十九遍，燃四十九灯，乃至四十九日光明不绝。可得过度危厄之难，不为诸横恶鬼所持。是故今日与现前众等，各各翘懃烧香、散花，燃灯、造幡，放生、修福，今度苦厄，不遭众难。惟愿如来证明忏悔。某等又复无始以来至今日，凡有所为皆不称意：当知悉是过去已来恶业遗报所致。是故今当勤求忏悔。

忏悔人间恶梦恶相，诸不吉祥之报。
忏悔人间恶病连年、累月不瘥。枕卧床席，不能起居之报。
忏悔人间冬瘟、夏疫，毒疠、伤寒之报。
忏悔人间水火盗贼，刀兵危险之报。
忏悔人间为被狮子、虎狼、毒蛇、恶蝎、蜈蚣、蚰蜒害人之报。
忏悔人间生老病死、忧愁苦恼之报。
忏悔众生身语意业，造作增长种种恶业之报。
忏悔众生当堕三恶趣中，无量千岁受 诸剧苦之报。
忏悔众生为应以地狱、傍生、鬼趣流转无穷之报。
忏悔众生不复更生诸余恶趣之报。
忏悔众生为人奴婢受他驱役之报。
忏悔众生或作牛马、驼驴，恒被鞭挞之报。又常负重，随路而行。饥渴逼恼之报。
忏悔人间厌魅、蛊毒、飞尸、邪鬼，伪作妖异之报。

如是现在未来人天之中，无量祸横。灾疫死难衰恼之报。众等今日至诚，向药师佛、海会圣众，求哀忏悔，愿皆消灭。前已究竟，是病是药，同归一幻。恶业所致，一切报障，今当次第，发愿回向。某等愿以此忏悔三障所生功德。悉皆回向施与一切众生。俱同忏悔。愿与一切众生，从今以去乃至菩提。念生死苦，发菩提心。改恶修善，返邪归正。身心安乐，妙算无穷。衣食丰饶，家属资具，仓库盈溢。形相端正，聪明智慧。勇健威猛，诸将拥护，佛圣匡扶。凡所施为，悉希慈荫。弟子某等。又愿从今以去，速证菩提，相好光明，庄严殊胜。愿诸众生，蒙光开晓，随意所趣，作诸事业。愿诸众生，皆得无尽，所受用物，无所乏少。愿诸众生，建立大乘。悉令安住，菩提道中。愿诸众生，得不缺戒。设有毁犯，还得清净。愿诸众生，端正黠慧。诸根完具，无诸疾苦。诸众生，众病悉除。家属资具，悉皆丰足。愿诸众生，转女成男。具丈夫相，乃至菩提。愿诸众生，出魔罗网，解脱一切外道缠缚。愿诸众生，王法所加，悲愁煎逼，皆得解脱。愿诸众生，饮食饱足，后以法味，毕竟安乐。愿诸众生，如其所好，种种衣服，随心满足。愿诸众生，长寿富饶，官位男女，凡有所求。一切皆遂。令诸世界，百怪九横、八难三灾、他国侵扰、盗贼反乱、一切恶难，尽皆消灭。国界安稳，风雨顺时，谷稼成熟。一切有情，无病欢乐。菩提行愿，念念增明。救苦众生，常如己想。又愿生生世世，在在处处，不堕边僻。生正信家，相貌端严，智慧辩才，远离恶法。亲近善友，坚持律行，安立大乘。又愿生生世世，在在处处，兴显佛法。破诸魔网，奋志满修。六波罗蜜，广修供养，福慧庄严，忍辱精进，证菩提道。我等今日，应当念报。药师琉璃光如来恩德，常应如是利益安乐一切有情。是故至心，归命顶礼。

消灾延寿药师忏法卷中

南无薄伽伐帝。鞞杀社。窭噜薜琉璃。钵啰婆。喝喇阇也。怛他揭多耶。阿啰诃帝。三藐三勃陀耶。怛侄他。唵。鞞杀逝。鞞杀逝。鞞杀社。三没揭帝莎诃。

赞

东方端坐　无上医王　十二大愿妙难量　灭罪殄灾殃　降福垂祥　增益寿绵长　
药师佛　药师佛 消灾延寿药师佛　南无消灾延寿药师佛(如前起佛偈绕坛念佛回向)

佛身充满于法界　普现一切众生前　随缘赴感靡不周　而恒处此菩提座
消灾延寿药师忏法卷下

三世诸佛怋念众生，为说药师道场忏法，今当归命一切诸佛。

南无毗卢遮那佛　
南无本师释迦牟尼佛　
南无药师琉璃光如来　
南无无量寿佛　
南无尽十方遍法界过去一切诸佛　
南无尽十方遍法界现在一切诸佛　
南无尽十方遍法界未来一切诸佛　
南无药师琉璃光如来本愿功德经　
南无日光遍照菩萨　
南无月光遍照菩萨　
南无文殊师利菩萨　
南无观世音菩萨　
南无得大势菩萨　
南无无尽意菩萨　
南无宝昙华菩萨　
南无药王菩萨　
南无药上菩萨　
南无弥勒菩萨　
南无消灾障菩萨　
南无增福寿菩萨　
南无乐音树下三万六千菩萨　
南无阿难尊者八千比丘诸大圣僧 　
南无救脱菩萨

礼诸佛已，次复忏悔。弟子某等上来既忏悔已。应生无垢浊心，无怒害心，于一切有情，起利益安乐慈悲喜舍平等之心。于是敛念正观，不断结使，不住使海。观一切法空如实相。云何名观一切法空。行者谛观现在一心。妄心随所缘起，如此之心为因心故。心为不因心故。为亦因心亦不因心故。心为非因心非不因心故。心为在三世，为在内外中间，有何足迹？在何方所？如是等种种因缘中，求心毕竟不可得。如梦如幻、无名无相。尔时行者，尚不见心是生死，岂见心是涅槃。既不得所观，亦不得能观。不取不舍，不依不着，亦不住寂然。言语道断，不可宣说。观心无心，则罪福无主。罪福性空，则一切法皆空。心无所心，法不住法。作是忏悔，名大忏悔。名破坏心识忏悔。以是因缘，心心寂灭，念念无住，如太虚空。虚空亦不可得，究竟不可得，亦不可得。自然超诸三昧，光明照耀。万法显现，通达无碍，广大如法性，究竟如虚空。惟愿得如所愿，满菩提愿众等各各运心，归命顶礼。

南无毗卢遮那佛　
南无本师释迦牟尼佛　
南无药师琉璃光如来　
南无无量寿佛　
南无尽十方遍法界过去一切诸佛　
南无尽十方遍法界现在一切诸佛　
南无尽十方遍法界未来一切诸佛　
南无药师琉璃光如来本愿功德经