密教金胎两界（两部）曼陀罗就是将大日如来教主的教义以佛、菩萨、明王、诸天等的形象表达出来，涵括法界一切万有之体、相、用（所谓六大、四种曼荼罗和三密），故而两界曼陀罗又称为普门曼陀罗，代表一切众生本有（胎藏）与修生（金刚）的修行历程。

　　以《大日经》为蓝本具象化的胎藏界曼陀罗全名为大悲胎藏界曼陀罗，它和以《金刚顶经》为蓝本而形成的金刚界曼陀罗，在唐朝因为“开元三大士”的鼎力协作互相教授补充，成为“两部一具”，由此形成相当完整的唐密法门一派。　　

　　胎藏界曼陀罗代表理，胎藏梵文garbha意为“胎”“藏——库藏”，比如胎儿在母体内受到保护、养育，比喻众生本来具备的菩提心之“理”，以大日如来大悲万行功德而得常养；金刚界曼陀罗代表智，金刚梵文vajra音译嚩日罗，喻如金刚般坚硬无比，可以克服一切，象征法身如来智慧坚固不坏。胎藏界曼陀罗有三部十二大院，佛部、莲部、金刚部分别代表中台八叶院（中台和八叶可以分为两院）、遍智院、持明院、释迦院、金刚部院、莲花部院、文殊院、除盖障院、虚空藏院、地藏院、苏悉地院、外金刚部院。金刚界曼陀罗则有五部九会，佛部、金刚部、宝部、莲花部、竭磨部，九会依下转次序为成身会（竭磨会）、三昧耶会、微细会、供养会、四印会、一印会、理趣会、降三世会和降三世三昧耶会。

　　惠果祖师用阴阳五行思想，对胎藏界曼陀罗和金刚界曼陀罗包含的密教教理以二元论巧妙分析，故提出金胎不二的立论，并将此思想传输于空海，对空海后来的密教理论产生了莫大影响。　

　　如果说胎藏界曼陀罗以地、水、火、风、空、识六大来阐明宇宙生成之本源的全息哲学观，那么金刚界曼陀罗就是六大所生成的宇宙之森罗万象的具体表现。

　　第二节　胎藏界曼陀罗

　　胎藏界曼陀罗是以《大毗卢遮那成佛神变加持经》简称《大日经》为蓝本而具象化的大图画（曼陀罗）形象，故而全称大悲胎藏生曼陀罗。在母亲子宫内，由精子和卵子结合成为受精卵，从而由单一受精卵细胞不断繁衍分化最终发育成胎儿，胎儿在未出生前处于母胎，靠母体通过脐带供给血液而获得营养和氧气。胎儿就好比一切有情本具的大悲菩提心，而此大慈悲心受到佛的无边智慧功德藏化育哺乳不断成长。胎儿出生好比菩提心成就从而成佛——由八识田发掘出清净菩提心以至于发芽开花结果而成为庵摩罗识，而胎藏好比一切有情所本有的菩提种子之八识田——藏识，如此借助胎藏界曼陀罗我们可以很方便地理解密教的教理。

　　在胎藏界曼陀罗中，中央为法界清净法身大日如来（毗卢遮那如来），周围四方四佛分别为东方宝幢如来、南方开敷华王如来、西方无量寿如来、北方天鼓雷音如来和四隅的普贤菩萨、文殊菩萨、观音菩萨、弥勒菩萨，以及其他十一大院的佛、菩萨、明王、诸天共四百零九尊。

　　十二大院可以依照《大日经》三句“菩提心为因，大悲为根本，方便为究竟”来分析。

　　因──菩提心──中台八叶院的九尊

　　根──大悲──除外外金刚部院全部诸尊

　　究竟──方便──外金刚部院

　　如此由内向外，就是大日如来的大悲心功德救度一切有情；而由外向内，则表示一切有情本具菩提心显现发起、证入、证得、涅磐和最终一切皆表如来方便竭磨事业也。整个胎藏界曼荼罗依照《大日经》皆系大日如来所化生，由此密教中心、佛、众生三三平等的教理栩栩如生地表达了出来，而平等正是大乘佛教的基本原则，故又曰理曼陀罗。

　　一、中台八叶院

　　五佛四菩萨，其中大日如来结法界定印，首戴五佛宝冠，形象若然菩萨。就法界定印，左手代表众生，右手代表如来，二手重叠表示佛与众生一体不二。其四方四佛各着红色袈裟呈现如来形象，宝幢如来与愿印表满足众生一切所需之誓愿；开敷华王如来施无畏印表守护众生之誓愿；无量寿如来弥陀定印表使众生安泰禅定之誓愿；天鼓雷音如来触地印表降服魔怨誓证无上菩提。四佛分别象征佛子有情开发佛性、发菩提心（宝幢如来）；佛子之六度万行（开敷华王如来）；佛子觉悟（无量寿如来）和证入涅盘境地（天鼓雷音如来）。四佛四菩萨各据一瓣莲花为座，莲花在佛法中本来代表清净无染，象征如来清净法身和比喻一切有情的菩提心。在瑜珈观想中此八叶莲花涵括无限法界，预示宇宙万象无不共存共生于此法界中。就曼陀罗所表现的时间性而言乃恒常三世。

　　二、遍智院（佛母院）

　　位于中台八叶上方（在胎藏界曼陀罗，东方在上；金刚界曼陀罗东方在下），中间乃一切如来智印，三角形外绕火焰，表示一切如来智慧之火，寓大勇猛心以表降伏之智德。三世十方诸佛之能成正觉，皆由此智火，降伏四魔（烦恼、阴、死、天）而实现。大勇猛菩萨坐於胎藏界曼荼罗遍知院三角智印之左，梵名摩诃尼罗，译言大勇猛，密号称为严迅金刚。遍智印最左面为大乐不空金刚真实菩萨（与大乐金刚萨埵同），梵名摩诃嚩日罗母伽三昧耶萨怛鍐，译作金刚不空真实菩萨，密号称为真实金刚，即普贤延命菩萨。遍智印右面为佛眼佛母菩萨。所谓佛眼乃五眼之一。佛名觉者，觉者之眼云佛眼，照了诸法实相之眼也。又别於前之四眼，四眼至佛眼则总名为佛眼。《无量寿经下》曰“佛眼具足觉了法性。”《法华文句》四曰“佛眼圆通，本胜兼劣，四眼入佛眼，皆名佛眼。”《毘尼止持音义》曰“谓具肉、天、慧、法四眼之用，无不见知。如人见极远处，佛见则为至近。人见幽暗处，佛见则为明显。乃至无事不见，无事不知，无事不闻。闻见互用，无所思惟，一切皆见也。”而此智德者，诸佛能生之德，列于佛眼佛母尊，故此院又称佛眼佛母院。示如来之正觉，无上胜功德，及诸佛能生之功德。最右面为七俱胝佛母菩萨，准提观音之异名也。俱胝者“七亿也”。释迦如来在给孤独园，入准提三摩地，说过去七亿佛所说之准提陀罗尼，故约过去佛之所说，谓之七俱胝。约陀罗尼之主，谓之准提，是为莲华部之母（诸佛有部母与部主），司生莲华部诸尊功德之德，故名佛母尊。《七俱胝佛母所说准提陀罗尼经》曰“愍念未来薄福恶业众生故，即入准提三摩地，说过去七俱胝佛所说陀罗尼。”以上遍智院五尊。

　　三、持明院（又名忿怒院）

　　中正为般若菩萨（般若佛母），其余分别为右面不动明王、降三世，左面胜三世、大威德明王共五尊。般若菩萨为胎藏界法身大日如来之正法车仑身，具有般若之妙慧，如觉母之在胎藏中涵藏。不动明王是胎藏界大日如来教令轮身，余胜三世、降三世明王代表金刚部主尊之教令轮身；大威德明王代表莲花部主尊之教令轮身。在密法中，一切本尊教令轮身皆现忿怒身唯孔雀明王例外。此院五尊除般若菩萨外皆忿怒形又名忿怒院。称持明院者，乃忿怒形之四明王，乃佛部、金刚部、莲花部主尊之持明使者，为降服顽劣持忿怒真言，幻化忿怒火焰而威伏之故。