据吐蕃王朝有关史书记载,该寺形成以前,楚布地有公元九世纪中建立的石碑和藏王阿达赤热所居住过的羌普宫殿聂卡以及吐蕃大臣样次蚌多日所建的四人比丘修行殿。后来,楚布寺是噶当两派合为一体的娘米达布拉吉的弟子贡堪堆松堪巴(第一世噶玛巴)在藏历第三绕炯土鸡(公元1189年)创建,成为噶举派的土寺:贡堪堆松堪巴于藏历第二绕炯铁虎(公元1110年)在后藏朵康地区芝雪地方出生,十六岁出家,到曲郭嘎扎寺拜师格扎入师受沙尼戒律,法名为曲吉扎巴,二十岁到的藏拜堆龙加马瓦和恰巴曲吉师格等许多大师苦学佛经,特别从蛔米达布拉吉叔侄处听取许多教海,修炼后智慧大增,到藏区各地学经修行多年,在藏历第三绕炯(公元1189年)年,八十岁时来到堆龙楚布地方,并看出该地区的特殊地形,如后山显有大慈大悲的像,前山呈度母白显等吉样征兆后,在该地修建丁四方形修行殿,后来逐步扩建喜巴扎仑,同时收有四十个僧人,并依次建大殿等,藏历第三绕炯水牛(公元1193午),大师八十四岁时在楚布寺圆寂。
该寺盛行的教派叫楚布噶举(教派以地取名)或噶玛噶举(教派以活佛名称取名)派,噶玛两词是梵文(意为:二时诸佛之功业),既堆松堪巴具有诸佛(智慧)功业之主,胜乐佛会传授灌顶和十万空行母头发编制成的黑帽戴上头功业之无比,故活佛称噶玛巴、从此以后历代该教派的活佛噶玛巴转世,都称噶玛巴并戴黑帽。噶玛巴是西藏活佛转世灵童的第一个活佛,从此在藏区开始盛行活佛转世灵童的习俗,堆松堪巴是第一世噶玛巴,也是藏传佛教中第一代转世灵童的活佛。
第二世噶玛巴八西时,开始扩建楚布寺,先后建有:大殿(卡),喜巴扎仓、曲康宫、苏日等。大约有14766.15平方米建筑面积,最高建筑有五层楼,周边有各种大小不同的扎仓。第二世噶玛巴八西在藏历第四绕炯(公元1255年)时,由元世祖忽必烈邀请,册封爵位,赐金章等。第二至五世噶玛巴都被元朝皇帝邀请并赠送过重礼。第六世噶玛巴扩建喜巴扎仓。楚布寺的大殿由第七世噶玛巴时修建,后来七世噶玛巴到各地朝佛时,大殿改名为卡扎仓,修建大殿的同时扩建苏日扎仓和颇章所属各种大小殿。
楚布寺在西藏历史上,不仅在各种教派中享有名望,而且该寺的文物、佛像、佛经、佛塔等内供法器在过去很有名。俗话说:“权不能比地方政府,财不能比楚布寺”。寺内主圣有:第二世噶玛巴八西时,铸造的释迦牟尼响铜像,大小约有十二步弓的九供大佛,和第八世噶玛巴亲手塑造的镏金白银佛像、悬空银佛为主的各种佛经、佛塔、佛像等许多圣物。大殿上金色辉煌的金顶,寺内有各种宝石镶嵌的历代噶玛巴灵塔和灵塔殿,大院中央有各种经幡编制成的达钦扎西仁母等举不胜数的历代收臧的奇珍异宝和占瓷器、唐卡、古代丝绸等文物。但后来文革十年内遭到破坏一无所剩。现在以往的规模上重新修建该寺。过去寺庙的权利掌握在卡拉章(噶玛巴)手中,寺庙和拉章总管直接由卡拉章指定,整个寺庙分有:孜、雪两郎分,其中孜是噶玛巴的佛殿、卧室、餐厅等,雪有古宫巴、德羌、恰康等责任不同的管家:其中恰康管理楚布寺属的南北农牧民、农田、牲畜和远处所属各小寺喇嘛 收管信徒的蹭物,寺属农牧区征税,调解寺属纠纷等。
日常佛事活动中。卡扎仓召集卡钦古多集体佛事外,各殿长期召开各自的佛事。每年藏历4月10日定为楚布牙羌姆节(跳宗教舞和藏戏),跳本寺编排的羌姆舞时,有时噶玛巴亲自参加跳舞。每次过楚布牙羌姆时,从拉萨、那曲等各地的信教群众纷纷到楚布寺朝佛,拜见噶玛巴,观看节目、楚布寺后山腰上有四十多名闭关修行的高僧,这些高僧三年零四十五天内与世隔绝,长达1140天内,食物专人提供外不与任何人联系,在山洞中独自修行;寺属曲喜(寺庙庄园)有:那嘎桑珠通门喜嘎、尼木苏口喜嘎、休朗加仲喜、强郎人等牧区曲喜。
党的十一届三中全会召开后,国家拨款和各地信教群众等筹资捐款后,1981年开始维修卡扎仓、喜巴扎仓,伟色林、上下曲康等。开始追查十年动乱内流失的圣物。僧人发展到三百左右。