第十二大愿：愿我来世。得菩提时。若诸有惜。贫无衣服。蚊虫寒热。昼夜逼恼。若闻我名。专念受持。如其所好。即得种种上妙衣服。亦得一切。实庄严具。华丽。涂香。鼓乐。众伎。随心所欲。皆令满足。

曼殊室利。是为被世尊药师琉璃光如来。应正等觉行菩萨道时。所发十二微妙上愿。复次曼殊室利。彼世尊药师琉璃光如来。行菩萨道时所发大愿及彼佛土。功德庄严；我若一切劫。若一劫余。说不能尽。然彼佛土一向清净。无有女人。亦无恶趣。及苦音声。琉璃为地。金绳界道。城关宫阁。轩恋罗纲二皆七宝成。亦如西方极乐世界。功德庄严，等无差别。于其国中有二菩萨摩河萨。一名月光遍照。二名月光遍照。是彼无量无数菩萨众之上首。次补佛处。悉能持彼世尊。药师琉璃乐如来。正法宝藏。是故曼殊室利。诸有信心善男子。善女人等。应当顾生彼佛世界。

供奉药师佛，其佛像像身应该是晶盈透彻。无丝毫杂质，信众亦应在供奉之时，诵读药师琉璃光如采本愿功德经或药师神咒，或消解病咒，念至深处，可观想自己也完全透彻，无色无体。只要诚心观想药师琉璃光如来便可，与药师佛感应，即可获佛力加持；得无尽福；世间物质，亦一样丰足、富饶。

供奉药师琉璃光如来。与供奉其他佛菩萨一样，有几点要注意：大家可以参考观世音菩萨篇

 

药师咒意译

南谟薄伽伐帝，鞞杀社窭噜，薜琉璃，钵喇婆，喝啰阇也，怛陀揭多耶，阿啰喝帝，三藐三勃陀耶。怛侄他：唵！鞞杀逝，鞞杀逝，鞞杀社，三没揭帝，娑诃！

现在就来分解∶

南无——皈依礼敬，有时简短说【皈命】。

薄伽伐帝——即是【世尊】“薄伽梵”另一音译。因此念时帝音是轻声的t音。

杀社——“社”字发音现在有人注为“及牙——连音”，其实社字用台语发音(“西牙”连音)就很正确了。意思是【药】。

噜——【师】现在也用“古鲁”。

薜琉璃——这句也音译为“排都里牙”，即是【琉璃】

钵喇婆——【光】的意思。

喝棉　也——【王】，因为药师佛为东方七佛之首(这依世尊提及的顺序而列)。

怛他揭多也——【如来】(也译“打他噶打牙”)

阿棉喝帝——【应供】

三藐三勃陀耶——【正等正觉】

怛侄他——【即是】也译为“所谓”。

——身语意【三身皈命】，即“真正的咒心”，真言门用来启动咒语之用。

杀逝、　杀逝——【药、药】，“逝”(读音“接”)为多数词连用时的变音

杀社——【药】，单用或连用一字时的结束词。

三没揭谛——【自度度他】。“没”字音为“墨”字，有译为“母尔”。

娑诃——【圆满达成】。也译为梭诃，或其它如“娑婆诃”等。

所以整句咒的意思是∶

【皈命世尊药师琉璃光王如来应供正等正觉，即是三身皈命药、药、药，自度度他，圆满达成】所以药师如来有三种药，身药、语药、意药，身药找医师，语药靠慈悲，意药便是清净心，三药能去病，三业障难自然消除，是不是很有道理？