科迦寺，现属萨迦派，位妄自尊大阿里地区普兰县科迦乡科迦村，因地名而得寺名，又说因该寺系古格王科熟所建（见《西藏王统记》），故地名寺名均称笠迦。寺庙建於两山间的平地上，这反映出西藏早期寺庙选址受印度影响的特徵，不同於后期多建於离开村壮的山坡上。

　科熟王信仰佛教，用七大包银子请尼泊尔和无什米尔工匠於中尼边境协噶尔（今定日县所在地）制作了一尊世间罕见的文殊菩萨像。用车运回王宫途中，在杰玛塘被有着神奇传说的圣石阿莫穆噶所阻，相传菩萨像开口说“科迦、科迦”（意为依附或扎根於此），故科熟王遂命围绕圣石建筑了造型奇特的殿堂，将文殊像供於殿内圣石之上，是为科迦寺的最早建筑。拉德王时，用大量珍贵珠宝和白银，为此像制作有30朵莲花的宝座，并为该寺修建大经学友，举行了大规模的开光庆典。贡德王码汉卡执政时助该寺制作银质的金刚持和观世音像；供於莲花宝座的两端，形成科迦寺有名的“三至尊”。因该寺位於孔雀河岸边，为防止洪水危害，扎西德赞执政时，动员群众修建了防洪堤坝，开古格王朝筑提之先河。后来历世古格王及其后裔陆续添帛佛像、经籍、供器，维修或建殿堂，使该寺文物丰富，除忆提出及者外，还有古格王朝时期的金质度母像、响铜释迦像、《甘珠尔》、《丹珠尔》大藏经、整套《萨迦五祖遗高训》等，据说还有极为珍贵的“前宏期”翻译的《甘珠尔》经。

　由於该寺拥有珍贵佛像、稀世文物，加上神奇的传说和王室的扶持，古格五朝时对外已有较大影响，前来参观朝拜者不断。近年来，随着普兰县的对外开放，前来朝拜的印度、尼泊尔及拉达克、克什米尔竺地区的香客日益增多，科加寺又成为国巨区人民和友邻国家、地区人民文化交流的重要埸所。