(二) 三法印思想 1. 诸行无常 佛教是以缘起思想作为理论基础的，这使得他们对世间无常的认识和体验特别深刻。而“诸行无常”也是作为小乘佛学三法印之一提出的，这一思想在《百喻经》中也有体现，经中的《二鸽喻》故事中说：“凡夫之人，亦复如是：颠倒在怀，妄取欲乐，不观无常，犯于重禁，悔之于后。”【11】这里就是讲人贪求欲乐，“不观无常”，不知道这一切都是生灭无常的，没有究竟自性的，因此贪著不舍，以致违法乱纪的事也去做。
　　在第九十四个故事《摩尼水窦喻》中也说：“生死之中，无常、苦、空、无我。”【12】这里就把小乘佛法中常说的无常、苦、空、无我等基本思想都讲到了，这说明小乘佛法“诸行无常”思想的流传已较广，已为人们所认知了。
　　无常是佛教的基本思想，即认为宇宙间一切的法都是迁流不息的，是不能恒久的。“诸行无常”的思想在佛陀时代和佛灭后的四五百年很兴盛，印顺法师把这一段时期的佛教判为印度佛教的“初时教”，认为此时的佛教以三法印中的“诸行无常”为中心，其“理论、修行，并自无常门出发。”而学派上则以小乘说一切有部为代表。
　　2. 诸法无我 《百喻经》对“诸法无我”的思想多有阐述。《伎儿著戏罗刹服共相惊怖喻》的故事中说：“一切凡无夫，亦复如是：处于烦恼、饥俭善法，而欲远求常乐我净，无上法食。便于举五阴之中，横计于我，以见我故，流驰生死，烦恼所逐，不得自在。”【13】这里就说小乘佛学中讲的色、受、想、行、识五阴中没有一个真我。因为这五阴都是变化无常，没有自性的，都是空的，并没有一个我存在。而且五阴合起来也没有一个我存在，因为佛教认为五阴的性质各不相同，不可相合。《涅槃经》中说：“色与非色，性无合故。”【14】五阴中没有我存在，而众生以妄想、执着，认为有一个我存在，为此就流转生死，饱受烦恼的折磨了。
　　《见水底金影喻》的故事中也讲了五阴中没有真我的思想，故事中说一个人见水底有金子的形象，就下水去摸，结果是劳累不堪而又一无所得。后来他父亲来了，告诉他水里的只是金子的影子，真的金子挂在树上。故事后面说：“凡夫愚痴人，无智亦如是。于无我阴中，横生有我想。”【15】这个故事也就是说，所谓的我只是如同水中的影子一般，如同海市蜃楼一样，是虚妄的，是想象出来的，是不实在的。
　　经中的《宝箧镜喻》中还说到执着我见的害处，故事讲一个人捡到一个宝箱，箱子里装满了珍宝，珍宝上面有一面镜子。此人打开箱子一看，看到镜子里的自己，以为箱子里有人在看守宝物，于是就慌忙逃走了。故事后面说：“凡夫之人，亦复如是：为身见镜之所惑乱，妄见有我，即便封著，谓是真实。于是堕落，失诸功德，禅定道品，无漏诸善，三乘道果，一切都失。”【16】这个故事也就讲到人之所以堕落，就是因为执着我见，失掉自性中本来具有的清净功德。
　　经中用了这么多故事，从不同的角度，来阐述佛教中的“诸法无我”的思想。这正是说明公元2 世纪时，正是大乘佛教兴起时期，这一时期的佛教以讲一切法性空无我为主，所以印顺法师把这一时期的佛教说成是印度佛教的中时期，认为此时佛教以“诸法无我”印为中心，其“理论之解脱，修行之宗要，并以一切法（无我）性空。”这一时期的大乘性空理论，以龙树中观学为代表，而《百喻经》的作者生活年代正是与龙树生活的年代相近的。
　　四谛中的灭谛，三法印中的涅槃寂静印，是讲述佛教的涅槃思想的。经中对佛教的最高理想涅槃思想讲得并不多，只是在第五十五个故事中提到“愚人亦尔……其意劣，奉持少戒，便以为足，不求涅槃胜妙法也，无心进取。”【17】《百喻经》中没有多讲涅槃，这或许是因为作者处在大乘佛教兴起时期，此时的佛学以龙树的大乘空宗理论为主，而很少讲到大乘有宗讲的涅槃、妙有思想，对“妙有”讲得较多的是龙树中观学后的瑜珈行派。
　　三 《百喻经》中的大乘佛学思想
　　《百喻经》产生于公元二、三世纪之间，那时大乘经典已陆续出现，随后大乘佛教诞生。大乘佛教思想在《百喻经》中也得到了反映，如《送美水喻》故事中说“如来法王，有大方便，于一乘法，分别说三”，这是对《法华经》思想的阐述。而大乘佛教初期以《般若经》的影响最大，《百喻经》由于与中观学的诞生时代相近，所以从经中也可以看出中观般若思想对它的影响。
　　（一） 中道思想
　　经中的《梵天弟子造物因喻》故事中说：“诸佛说法，不著二边，亦不著断，亦不著常，如似八正道说法，诸外道见是断见常已，便生执著。”【18】这里说的不著二边，就与龙树讲缘起中道思想相近，不著两边就是说万法因缘而起，既不是恒常的有，也不是绝对的无，假名有和自性空是一个事物的两个方面，空即是有，有即是空。故事中接下来说的“亦不著断，亦不著常”，这正也与龙树的八不思想相似的。《中观·观因缘品》中说“不生亦不灭，不常亦不断，不一亦不异，不来亦不出。”【19】这就从八个方面排除了人们对概念名相的一切执著，这八个概念中以生灭概念为最难破除，破除了生灭，也就破除了断常、一异、来出。因为不生不灭，则其它三对范畴也就同样不能成立了。
　　而在第九十四个故事《摩尼水窦喻》中又进一步提出了中道思想：“生死之中，无常、苦、空、无我，离断常二边，处于中道，于此中过 ，可得解脱。”【20】这就是认为人能以空否定对事物的实有的执着，又能不执着于空，离断常边见，看到事物是缘起的，是空，但又同时看到事物是有假名的存在的，这样同时看到事物的假名有和自性空，就是佛教的中道正见，就能得到解脱了。第五十六个故事《索无物喻》中也讲到了这种中道思想，故事中说有两人在路上帮人推车，拉车的人答应以“没有东西”报答他们，结果当这两个人索取报酬时，自然是什么也没有得到。因为“没有东西”只是一个虚假的名称而已，并无实物。故事后面说：“若无物者，便生无所有处，其二人言无物者，即是无相、无愿、无作。”这里是教人看到“无物”只是概念，从而知道万物只是假名有，就能当下即空，无奈世人执着于法有，说了一个“无”，就执着于无了，人能不执于有，又不执于无，也就能见到佛教的中道了。
　　（二） 识的虚妄
　　《百喻经》由于深受诸法无我思想的影响，所以它就否定了心识是恒常的看法。《病人食雉肉喻》的故事中，讲到一个医生叫病人吃一野鸡来治病，病人吃了一只就不再吃了，因此病就没有治好。故事后面说：“一切外道,亦复如是，闻佛菩萨无上良医说言：当解心识。外道等执于常见，便谓过去、未来、现在唯是一识，无有迁谢。”【21】这个故事里，执着于心识为常的人被称为外道，被认为是执于常见。因为从缘起理论上看，有一个恒常不变的心识，这是不可能的。所以《百喻经》中说：“一切诸法，念念生灭，何有一法，常恒不变。”【22】这说明当时人们在《般若经》的影响下，倾向于彻底的中观缘起理论，而批判心识常恒不变的思想。