二次大战期间,弘法精舍曾遭日军占领,梵呗绝响。抗战胜利后,幸得王学仁、林楞真两位居士协助,按东莲觉苑之方法成立保管董事会,延绩弘法精舍培育僧才、办佛学教育的精神。1948年,倓虚法师应邀抵港在页恭绰、王学仁、楼望缵、林楞真诸居士支持下,创办华南学佛院,由东莲觉苑提供弘法精舍作佛学院之辽址。
倓虚法师出任华南学佛院院长并负责主讲,其余讲师还有:定西法师、乐果法师。佛学院以三年为一届,首届学僧二十名,主要来自北方及上海,计有:慧闲、法藏乐渡、宝灯、大光、永惺、圣怀、智开、智梵、圆智、妙智、性空、妙观、济涛、净真、妙境、达成、常安、圣铎、明达;今俱为佛教大德。
开办之初,经费负担沉重,学僧需半工半读,於是登山采椎,开田种菜织袜、印刷......,惟仍觉拮据。最后,得吴蕴齐、江上达等居士及四众热心之士资助,并设定每年办水陆法会一次,筹募经费,学佛院方得以持续下去。
1952年首届学僧结业,倓虚法师请辞,惟董事会挽留。同年招收学僧二十余人,教学内容仍如首届,包括楞严、法佛、法华、唯识、止观、净土、各项仪轨、历史、地理等。第二届学僧於1954年3月结业。结业后,不少学僧赴海外各地弘法。至此华南学佛之经济已不成问题,但因新学僧来源暂缺,僧校育僧任务遂告结束。惟育僧弘法已成弘法精舍一优良传统。
倓虚法师1963年往生后,精舍曾分别借予能仁书院、香港佛教书院作校舍。
为了延续弘法精舍办教育、弘佛法的传统,精舍自1999年起,以“香港佛教学院”名义开办佛学证。教授佛学知识,行解并重,培养弘法人才。赏不论僧俗。学院院长为严自台湾佛光山的慈惠法师。