陈致虚将心区别为肉团心和虚空心。其曰：“有肉团心，有虚空心。此虚空心是名何心？是金刚心，是涅槃心。彼肉团心复名何心？是妄想心，是烦恼心。世人思虑总皆执着，故是为障碍……彼一切心争爱贪著，见色迷恋，闻声惊怖，是非分别，无有穷已。此一切心，凡所闻见，如如不动……若大智慧，心即云佛；若大了悟，佛即云心；若大解脱，非心非佛；若大因缘，即心即佛。此心即性，此性即佛，性佛不离，佛性明了”[4]（P.69中）。肉团心之称见于宗密《禅源诸诠集都序》，为四心中的第一种心[11]。《坛经》没有明显提出虚空心之称，但是曰：“心量广大，犹如虚空”[8](P.49)，可见肉团心和虚空心的提法都来自禅学。
　　 陈致虚区别肉团心和虚空心，是将真心、妄心视为一心，将心性视为不二，指出区别只在于有念、无念之间，只在有执、无执之差，执着便是肉团心、妄心，不执着便是虚空心、真心。其曰：“尽他业风沙起、沧海尘飞，须知净倮倮底如如不动，那赤肉团上稳稳当当。须知这赤洒洒底如如不动，尽他我万死万生，此为不落窝臼，不迷境物”[3]（P.61下）。如如不动，便是无念无住，便是不起妄念，不滞虚假万法，不执妄相。正如惠能要人“除妄不起心”，“无念为宗，无相为体，无住为本”，“离相不乱”[8](P.28、31、37)。这样便能自在解脱。陈致虚曰：“生死岸头，如如不动，得大自在”[3]（P.64中）。
　　 心性不二的理论，直接导致顿悟说。陈致虚阐述曰：“外不见大地山河，内不立闻见知觉。直下摆脱情识，一念不生，证本地风光，见本来面目”[3]（P.63上）。陈致虚描述顿悟体验曰：“似风云雷雨，蓦然黑暗。须臾散去，红日当空，谁不见了。”[4]（P.67上）“若脱了桶底子相似，豁然大悟，眼下见性，惊喜过望”[4]（P.68下）。陈致虚大概有亲身体验，其描述与禅宗大师们如出一辙。
　　 陈致虚又认为人有根器之分，有人能悟，有人不能悟。其曰：“大根器识，一见了然明白，更不惊疑。”[4]（P.66上）“若使钝根之器，到了总不是也”[3]（P.62下）。这些都是惠能的思想。对于钝根之人，陈致虚主张积功累行的渐悟（注：何乃川、詹石窗《论陈致虚的积功累行诗》论述了陈致虚的渐悟说。见《道韵》第5辑，第218-235页。中华大道出版部，1999年8月。）。
　　 惠能之后的许多禅宗大师的语录，也都为陈致虚引用。惠能之后，机锋、公案等参禅方式相继出现。陈致虚肯定这些方式，对禅宗的机锋、公案故事烂熟于心，大量征引，随处题拈。其曰：“拄杖刹竿，棒拂拳喝，一机一境，是皆佛祖旁开户牖，提振纲宗，亦有大机，亦有大用，亦有权，亦有实。一喝不可作一喝用，一棒不可作一棒行。要知宾主交参，前后际断，昭悬日月，把定乾坤……是故马祖一喝，百丈三日耳聋。吃茶也是，受食也是，鼻孔也是，灵骨也是，即心即佛也是，非心非佛也是。一株花，柏树子，麻三斤，衫七斤，风与月，石与泉，前圣后圣所遗公案，一题著总是了[3]（P.62中下）。他把这些机锋和公案比喻为“如引过河之纲”[3]（P.63上），“若牵织金之花”，指出这些都是引导学人明心见性。其曰：“凡次皆要诸人各认自己心，莫作他人见。”“此等公案，备难悉数，莫不皆是见性之旨”[4]（P.67上）。
　　 他描述悟机锋、参公案的过程曰：“人人到那田地，猛着力，暗中求，不惊不疑，无退无转，忽然相似，脚跟后稳稳当当，绵绵密密，照天灼地”[3]（P.63中）。他这里所说的“猛着力，暗中求”即起疑，“不惊不疑”即坚持参，“无退无转”即靠理性求解已经山穷水尽，“忽然相似……”即一下子跳出公案，发现自性，回归本我。
　　 　　　　二
　　 陈致虚不止于援引南宗禅学。他还向前进一步，认定南宗禅就是丹（注：久保田量远《中国儒道佛交涉史》提到赵友钦和陈致虚都是主张仙佛同源、三教合一，指出陈致虚将金丹和见性看成是同一的。见胡恩厚译本，第205页。金城书屋，1986年8月第1版。）。陈致虚引赵友钦的话曰：“坐禅入定一件，在得牟尼之珠。圣胎已成之后……谓之面壁端坐、修禅入定也”[4]（P.69下）。他又曰：“是以释氏修定坐禅，以土制铅，以铅制汞，铅汞归鼎，身心不动，是云修禅入定。”[5]（P.95下）“直指人心，见性成佛，即老子观妙之道也。”[2]（P.59下）“直指人心，见性成佛……即金丹之道也”[4]（P.66下）。陈致虚对此解释曰：“帝释谓释迦曰：‘诸行无常，是生灭法。生灭灭已，寂灭为乐。’此即交通成和之义也。释迦修之而为佛也”[12]（P.54下）。老子观妙之道和交通成和之义，皆指炼内丹。
　　 陈致虚关于南宗禅就是内丹的说法，等于认定南宗禅主张和实行性命双修。古代确有少数佛僧炼外丹，修内丹，行各种养生术，擅长医药。这些都属于修命之举。密宗的密法修炼的确既修心又修身，乐空双运法修明点气脉，与内丹类似。《楞伽师资记》曰：“初学坐禅看心，独坐一处，先端身正坐，宽衣解带，放身纵体，自按摩七八翻，令心腹中嗌（浊）气出尽，即滔然得性清虚恬净，身心调适。然安心，神则窈窈冥冥，气息清冷。徐徐敛心，神通清利，心地明净，观（照）察不（分）明，内外空净，即心性寂灭。如其寂，则圣心显矣”[13]。坐禅中的清神调气，也类似修命。但南宗禅并没有主张性命双修。南宗禅学认为，虽然自性真实，包含万法，但万法终究虚幻不实。明心见性追求的是精神解脱，无需修命。陈致虚关于南宗禅就是内丹的说法，不会得到禅师的认可，也与事实不符。
　　 陈致虚的时候，以宋代张伯端为祖师的紫阳派，还有金代王重阳创立的全真道，这两个教派合流已成大势所趋。陈致虚顺势就趋，编制谱系，将紫阳派并入全真道。后来，人们称前者为全真道南宗，称后者为全真道北宗。陈致虚兼受南北二宗丹法（注：王沐《悟真篇浅解》称陈致虚为南宗旁支。见该书第376页。中华书局，1990年10月第1版。）。张伯端的《悟真篇》早就开始融合禅宗思想（注：请参阅朱越利《禅宗思想对〈悟真篇〉的影响》。载释永信、吴立民主编《中国嵩山少林寺建寺1500周年国际学术研讨会论文集》，宗教文化出版社，1996年6月第1版。）。全真道王重阳及其传人也一直吸收禅学（注：张广保《金元全真道内丹心性学》论述全真道吸收禅学之事颇详。请参阅该书第276-302页。三联书店，1995年4月北京第1版。）。陈致虚援引南宗禅学，亦是继承全真道南北二宗的传统。但全真道南北二宗皆批评禅宗只修性不修命，以此说明禅低于丹（注：孔令宏《宋明道教思想研究》论述全真道对禅宗的批评颇详。请参阅该书第387-399页。宗教文化出版社，2002年4月第1版。）。陈致虚在这一点上拂逆道教祖师之意，发表独立见解，抗言说禅就是丹，表现出对佛教友好与平等相待的态度。陈致虚还引佛教神入丹法，要弟子炼丹时存思佛教神[7]（P.15下）。由此看，所谓禅就是丹的说法，不仅是对南宗禅情有独钟，更重要的是欲增加道教弟子对禅的亲切感。总之，陈致虚倡导禅丹，是要求弟子炼内丹不要忘记修禅，既要炼精气神，又要明心见性。