法雨寺的住持大德中，也有三个代表，一为明初创庵的大智，二是清初的别庵，三是清末的立山。大智为楚之麻城人，15岁投本邑定慧寺出家，数年后至建康牛首山，嘉靖二十七年(1548)，居燕京崇国寺，数月后在万寿山受具戒。然后住五台山5年，住伏牛山3年。三十六年还楚，住龙华寺转经，一年后入蜀至峨眉山，住12年。万历二年(1574)移住蜀北金莲庵，八年渡海至普陀光熙峰下结茅，曰海潮庵，并逐渐建立殿宇，是为法雨寺之始。不久，郡守改庵为寺。时值禅教中衰，大智以持戒精严知名，与云栖、憨山、紫柏诸宿并称于当时。万历二十年(1592)入寂，终年69岁。建塔于寺西雪浪山之麓。有弟子性贤、如寿，亦随住海潮寺，后者曾继任为住持。大智是法雨寺的开山祖，法雨寺开始时为一律寺。别庵俗姓龙，蜀高梁(今四川梁山县)人。12岁出家，22岁受具戒。之后于康熙二十五年(1686)应请前往普陀山任法雨寺住持。庵于瓦砾场中结茅，持律说戒，四方释子于是望风云集。二十八年，清圣祖赐帑敕建寺宇，庵亲自经理，法雨寺自大智开创，如光再造，后复被毁，至此而首创殿楼，功毕之后，别庵入京祝寿，被8次召见，9次进诗，凡所启请，无不应允，赐翰赐紫，为自古宠幸所未有。别庵还改革万历以来第习讲律的旧规，提倡禅宗大乘之学。法雨寺至此中兴，而别庵则为本寺禅宗的开山初祖。五十六年入寂，终年57岁，建塔于本寺莲花峰下之右。遗著有《续灯正统》、《祖师正宗道影》、《高峰宗旨纂要录》、《梅岑集》、《经山录》等。法嗣有洞彻、翠厂圭、玉峰、见火工、乐道、在?、文樵。其中的玉峰、见火工、乐道以及在?的弟子法泽四人相继为法雨寺住持。立山，俗姓缪，华亭(今江苏松江县西境)人。20岁出家，受具于大崇福寺。之后或住普陀，或住松江。同治九年(1870)掩关于普陀伴山庵，每日礼《华严》，参海众。时法雨寺久经兵荒，凋敝已极，立山应本山尊宿信真和尚及其法眷之请，出任住持，时在同治十一年。山以兴复为己任，竭力经营，整修不辍，数年间百废俱举，虽未全复旧貌，但大局已具。后在清凉冈筑常明庵作退身之所，至光绪十年(1884)迁居是庵，决志西归，念佛不辍。又令庵内二时课诵，二时念佛，永为恒规。他认为，“末世众生障深根钝，向上一著，不易凑泊，大悟尚难，何况实证?唯净土一法，三根普被，利钝全收，上圣下凡，皆当修持。”为此，他曾规定：几违念佛之旨者皆摈出法门。光绪十五年入寂，终年65岁。弟子数十人，其中之化闻继其任法雨寺住持。化闻弟子开如再继为本山住持。
　　普陀山的佛教主要是观音菩萨信仰，自古及今并无变更。从佛教最初传入普陀山时始，它就与观音菩萨结下了不解的因缘。山上的三大寺，寺寺有圆通殿，代代供奉观音像，其它的许多洞、庵或供奉观音像，或充满了观音显灵的神话传说。实际上，普陀山就是作为四大名山中的观音道场而闻名中外的。然而，就住山的僧人而论，他们除信仰观音、维护此一观音道场的神圣性之外，还有自己的独特信仰和修持。从前面有关普陀山三大寺的历史沿革和名僧大德事迹的介绍中可以看出，这里曾有过以习律持戒为主的时期，也有过所谓“易律为禅”的改革和禅宗称雄的时期。两者比较，禅重于律，禅活动时间长于习律持戒时间。仅仅从禅宗这一方面着眼，所谓的禅其实并非纯粹的禅，而是禅教并重、禅净双修。在禅僧中，有人“默诵《法华经》”、“日课《法华》”，有人“讽《华严经》”、“晨夕诵《华严经》、”日礼《华严》，有人“决志西方，念佛不辍”，甚而至于将此定为“恒规”，违者逐出教门等等。普陀山佛教的这些特点，正是中国佛教自宋元以后发展为亦禅亦教、禅教结合、诸宗俱修西方净土倾向的反映。