缘起是佛教的特色，同样的性空也是佛法的特色。龙树之中观见，在佛教中，无论是从印度，西藏还是中国，都曾引起很大影响。故我们将中观之典籍作为教学的第三体系，正是源于此。因为世间的生死与出世之解脱无不是缘起性的，由一切法是自性空而离常见；由一一切法是缘起而离断见。为了使学僧对第一、二体系中的所学产生偏执，而授以中论以确立中观正见，及藏传的入中论，菩提道次第论，入菩萨行论及各种仪轨，不著空有而入中道第一义谛，方可入世严土熟生，破邪显正，大小并扬。

 　　同时佛学院除教授上述体系外，并学习天台教仪，以明白天台智大师用“五时八教，一心三观”来判释世尊言教，修行位次之严禁密完整。“心佛及众生，是三无差别”众生是迷之佛，佛是觉悟之众生。故佛学院授大乘起信论，来提高学僧的本觉与始觉，使之合二为一而成究竟觉。对于南传上座郭之法宝清净道论，法句经，也必须研读。来体会禅定之境界。为了使学僧有一个全面的发展与提高，课程以经律论所诠之戒定慧为中心，同时还授古代汉语、佛教文学、英藏语、财会、书法等课程。

 　　总上所述，教学体系之内容包含了三大语系佛典，使学僧了解了佛法的全貌与次节。十分之七的研读佛学，十分之三学习文化，以达到佛学，文化知识的全面提高，以适应当今佛教，社会的发展，更好地为佛教事业服务。

　　    学修一体——戒为师

 　　学院始终将持净戒作为首要课题。因为无论何宗何派，是显是密，守护佛戒是一切功德之根本。故“一切众律中，戒经为上最。”学僧在校学习，除必须背诵所学各种藏经以外，还必须坚持丛林生活，早晚上殿，半月诵戒，过堂持斋，静坐禅修，结夏安居，一一如法如律而行，不越昆尼制。同时要求凡入学为学僧者，一律在佛学院受二部僧戒，兼学正学女六法两年。办学至今，隆莲法师已为四届学僧圆满地传授了二郭僧戒。受戒只是方便，目的是更好的持戒。为此，隆莲法师提倡以不杂不冗不过不及，正处中道为准绳，应重实际。

 　　佛学院的学僧，必须严格尊守学院各项制度。（如学生守则，课堂、上殿、过堂、会客、请假、卫生、出坡等）。这也是学院的戒。学僧概不应酬经忏佛事，因为佛法不是商品。正因为如此，使得正信修道之道风，精进不懈之学风，与纯净和合之文风在佛学院勃然兴起。做到了学僧生活丛林化，丛林学院化。达到了佛学信仰，修持与知识同步增长的目的。

 　　一九九零年佛学院增设研究班，连同专修班、中级班、学制各为三年，实现了三级十二年制一贯的体制。四川尼众佛学院自建院以来，历经十五个春秋，佛学院毕业的中专僧四届，大专僧三届，研究僧一届，现在校的还有大专、中专两班学僧。可谓硕果累累，毕业后的学僧皆已成为当地寺庙和佛协的栋梁之才。