正如有学者指出，“唯识瑜伽行派所认定的因果关系，乃至缘起，在根本上，是种子生现行的过程”（注：高崎直道等，《唯识思想》，华宇出版社，200页。）。因此在三层识转变当中， 阿赖耶识与转识之间的种现相生，处于核心的地位，正是在这种意义上，我们说唯识学的赖耶缘起论是一种“有”论。现行识的转变（分别）是以种子为因缘而生的果，同时又熏习种识。另外种子识的流转相续、生长还灭，都是与种现之间的相互作用分不开的。因此识转变是一个统一的整体。
　　 总之，以世亲、护法学说为代表的唯识学缘起说，将识转变的三个层次的内容建构到赖耶缘起的框架之内，使缘起学说具有了与以前完全不同的内容和结构。但是唯识学所实现的这种理论上的统一，是以牺牲“般若性空”的精神为代价的。这也反映了佛教史上一个有趣的现象，即一方面佛教理论的发展越来越复杂、缜密和完善，但另一方面理论却与作为佛教的生命源泉的直接的宗教体悟和人的活泼泼的现实生存越来越疏远。因此在四到八世纪唯识学所取得的辉煌的理论成就，似乎也正预示着佛教的发展已接近盛极而衰。传承世亲一护法衣钵的法相唯识学，在中土三传而绝，其在兹乎！