可以看出，台湾佛教发展自解严以后便进入了一个多元存在、相互协调，并且在许多重大佛事活动方面各自为阵的局面。佛教组织之间的差异性不仅仅表现在组织形式或影响世俗社会的具体途径上的不同，而且更多地表现在彼此之间在思想观念上的距离，除了四大山头之间的发展途径差异很大之外，还有一些佛教组织甚至以大腹地表明自己政治见解为自己的独特性，如万佛会，既是佛教组织又是依法登记的所谓“真理党”，其政治理念倾向台独，直接参与选举等各种政治活动。这应当是台湾佛教发展过程中出现的一个比较典型的特例。
　　1990年3月，在由台湾大学学生发起的要求进行全面的社会政治经济变革的静坐示威活动过程中，一些不满足于禅房静修的寺院僧侣也走上了街头。他们在台北的“中正纪念堂”高呼政治口号，发表《佛教救国救宪宣言》：“呼吁政府，贯彻实施真正的民主宪政，以正法治世，不邪枉人民。”○17由佛教徒直接参与的这场政治运动，表明了台湾佛教完全摆脱政治控制的阴影而拓展有利于多元化发展的空间。
　　解严之后，台湾佛教的发展速度是十分惊人的：这种发展并不仅仅凭借一般的社会政治经济资源，同时也包含了对中国传统佛教的批判，这种批判使得台湾佛教有了一个适应现体商业社会发展的教义变革的依据，并且以此回应了宗教生态中基督教的强劲攻势，使得台湾佛教在整个社会西化日益严重情况下，依然能够保持自己的影响力。对传统佛教教义的批判，主要是在太虚法师早在1908年便已提出的“三佛革命”，即呼吁对教理、教制、教产进行全面改革，力求适应时代，起到其应有的教化社会、拯救人类、领导文化的作用的改革思想基础上，经由印顺法师对这种“人间佛教”思想的进一步阐扬，为佛教从信仰层圈出发，契入社会、火化层圈，完成佛教的现代转向奠定了理论基础。可以这样说，在台湾发生的佛教教义的变革，影响了一整代信徒对佛教思想的理解与思考。在目前台湾的中青年僧侣中，已经少有人没有经受“人问佛教”思想的洗礼。目前慈济功德会已有会员300余万，佛光山的信徒也以数十万计，仅这两个山头的信徒数失就占了整个台湾总人口量的相当比例。
　　但是，在台湾佛教这种快速地向世俗普及的过程中，也同时出现了一系列佛教自身建设方面的问题。台湾有些学者认为，这些问题表明了现代怫教在大批地吸取并消耗社会资源的同时，也在大量地流失或消耗自己的宗教资源。在不断地参与社会活动中，佛教为了接近和迎合各种人群的需要，不得不低下自身作为一种精神和信仰资源的姿态，这种无限制的世俗化倾向，虽然在一定时期里取得了在社会层圈和文化层圈中较为浅层和表层的效应，但在这种表面繁忙热闹的大场面下，恰恰是修证法门的缺位，出现了所谓“泡沫佛教”现象。由于佛教有必须修持的法门以及传统传承下来的三藏十二部等，使得佛教组织内部本来就宗派法门众多，但是现在这些不同派别之间，在台湾许多地方已经演变成彼此门户森严，各拥地盘，山头色彩浓厚，更有一些道场开始出现私有化趋向，变成子孙可以继承的私人财产，完全丧失佛制十方道场的精神。尤其是在激烈地批判了传统佛教之后，台湾佛教虽然提出了一些适应现代社会需要的佛教理论，但距离建设一个完整而系统的现代佛教理论体系尚有着许多不足的地方，包括这领域里的学术研究水准和人才教育规模等。佛教是一个重自内证的宗教，这种“证”、“悟”本身就是一个包含着很强个体自悟与思考因素，因此，在这方面如果没有强调。以贯之的理性精神和严格的教义约束，则佛教面对社会大众所需要建立起来的权威性与合法性就必然受到各种各样的质疑。这对佛教本身的发展反而是不利的。对此台湾佛教界尤其是佛教知识分子开始有了越来越强烈的共识，即佛教同样作为一种宗教必须通过严格的信仰、祈祷、修行等宗教意识和宗教行为，通向超越现实人生的理想境界。因为佛教是以解脱为中已而展开悲智双运的生命升过历程，这一特征使它区别于绝对信仰外在的上帝、崇奉基督救赎的基督教，带有主体自由、自我觉悟的特点；又使它区别于重视现实伦常和俗世生活的中国宗教，带有强烈的出世性格。台湾佛教在变革的过程中，始终存在着自利与利他的两难、属灵与属世的摩擦、原教旨主义与世俗化运动的冲撞。到了现阶段，这方面的矛盾已经使得对佛教批判的批判上升为主要的问题。人们在、些媒体上可以越来越多地看到这样一种现象：对佛教提出尖锐批判的往往是最虔诚的佛教徒，批判的不是佛教本身，而是对背离佛教精神之行为的批判。
　　台湾佛教的这种反思体现在两岸佛教往来互动方面，则是出现了越来越多的台湾佛教组织回到大陆寻访自己的本宗祖庭，这一现象有可能逐步演变成为今后一个时期两岸文化交流的一个重要内容。它可能逐步改变一个时期以来，两岸佛教文化往来中，主要是台湾僧侣前来大陆的单向式交流模式，大陆佛教组织将在这种互动关系中在。定程度上影响着台湾佛教。对于许多台湾僧侣来说，历史上大陆的高僧典范。直是他们心目中所追慕的。当代台湾佛教包含着流传于亚洲各地的四大系，即汉传、藏传、南传与日本佛教。据台湾《世界佛教通讯簿》和《中华佛教通讯薄》统计数据显示，汉传佛教寺院数量在台湾所占的比例约占百分之九十以上，○18严而且汉传佛教与其它几个系的佛教不同，在体系之内各寺院之间的宗派色彩很少，主要是以创寺人或住持为该道场活动与发展的核心。这种情况有利于两岸佛教往来进一步地以一种比较稳定积极的方式和比较同一的姿态进行，有利于佛学交流朝着文化认同的方向不断推进。当然，我们还必须考虑到，虽然台湾佛教一直是以源自于大陆的汉传佛教为主体，但由于两岸之间有着相当长时期的文化离隔，在这样长时间里台湾佛教的发展及其所形成的文化形态上差异，到底以什么样的方式才能使这种交流更有成效？这同时也应该是大陆佛教界必须更多地思考的一个重要问题。
注释：
①黄启明作“艋甲与龙山寺”，《台北文物》第二卷第一期，1953年版，第47页。
②《台湾县志》第九卷。《台湾县志》系王礼编纂，陈文达、林中桂、李钦文共修，完成于1720年。
③郑成功称：“此膏腴之地，当寓兵于农。”见林熊祥著《台湾史略》，台北1973年版。
④增田福太郎，财团法人明治圣德纪念学会：《台湾本岛人宗教》，昭和12年3月31日出版，第21页。
⑤《文化志》卷中，第460页。
⑥陈玲蓉著：《日据时期神道统制下的台湾宗教政策》，第75页，台湾本上系列二，31，自立晚报文化出版部，1992年4月版。