我国对回鹘文献的研究起步较晚，发韧于20世纪50年代。在此期间，冯家昇先生先后发表了《回鹘文与回鹘文〈玄奘传〉》（《大公报》1952年3月4日）、《回鹘文写本〈菩萨大唐三藏法师传〉研究报告》（考古学专刊丙种一号，北京，1953年）、《刻本回鹘文〈佛说天地八阳神咒经〉研究——兼论回鹘人对于〈大藏经〉的贡献》（《考古学报》1955年第9册，183～192页）、《1959年哈密新发现的回鹘文佛经》（《文物》1962年第7～8期合刊，90～97页），引起了国内外学术界的广泛重视。

《玄奘传》记述了唐朝高僧玄奘由长安首途西行印度寻求佛法的传奇经历，于10世纪左右由著名的回鹘译经大师胜光法师译为回鹘文，现存写本多件，除巴黎、圣彼得堡和柏林所藏外，大部见藏于中国国家图书馆，凡250叶左右。冯家昇先生在长达35页的《研究报告》中，分九部分对该文献的译者、翻译时代、纪年方法及回鹘文译文本身等进行了较详尽的论述，并整理出“本书残叶与汉文本卷叶对照表”，为以后的研究提供了方便。此后，耿世民又对该文献的第七卷进行了研究，发表有《回鹘文〈玄奘传〉第七卷研究》（一）（《民族语文》1979年第4期，249～262页）、《回鹘文〈玄奘传〉第七卷研究》（二）（《中央民族学院学术论文》民族语文专刊第3辑，1980年，267～304页）。聂鸿音在《回鹘文〈玄奘传〉中的古音字》（《民族语文》1998年第6期，62～70页）中通过研究写本中的古音字以探讨当时西北汉语音韵；黄盛璋则撰文《回鹘译本〈玄奘传〉残卷五玄奘回程之地望与对音研究》（《西北史地》1984年第3期，9～23页）对该写本涉及到的中亚、印度地名、民族名称的对音进行研究；杨富学撰写的《回鹘文〈玄奘传〉及其相关问题》（《敦煌佛教艺术文化论文集》，兰州大学出版社，2002年，108～115页）则通过回鹘文译者对汉文底本的修改，以探讨该文献之意义及其所反映的历史文化现象。

《佛说天地八阳神咒经》是中土高僧所撰的“伪经”，在中原地区并不十分流行，正规的大藏经一般都不予收录，有趣的是，它却是迄今所知回鹘文佛经残卷中所占比例最大的一种经典，其抄本、刻本残卷在西域、敦煌诸地都有发现。冯家昇研究了现存于我国的折叠式刻本，计有三张七面半。其中二张中有“陈宁刊”三字。在冯先生研究之基础上，张新鹰撰《陈宁其人及回鹘文〈八阳经〉版刻地——冯家昇先生一篇旧作赘言》（《世界宗教研究》1988年第1期，127～131页），指出陈宁的雕版活动主要在元朝中叶，该文献的刻版地应在杭州。最近，刘元春又撰《〈佛说天地八阳神咒经〉辨析──兼谈高昌回鹘佛教的社会文化意蕴》（《西域研究》1996年第1期，50～59页），认为该经虽“伪”，但因其符合高昌回鹘社会的需求，故而得到广泛传播。

在冯先生发表的三件文献中，最受我国学界重视的当推1959年于哈密发现的回鹘文《弥勒会见记》。这件由586叶写卷组成的文献，是一部写成于公元8～9世纪左右的佛教剧本，由一幕序文和二十五幕正文组成，是现知篇幅最大、数量最多的回鹘文文献之一。作为我国现存最早的一部佛教原始剧本，有其独特而重要的地位。国人对该写本进行了一系列的研究，涌出一大批重要的成果。其中以耿世民贡献尤著，他单独或与他人合作先后发表了多篇论文和专著，荦荦大端者有《回鹘文〈弥勒会见记〉第二幕研究（Qadimqi Uygurca Iptidayi Drama Piyesasi Maitrisimit （Hami Mushasi） ning 2- Purdasi haqqidiqi Tatqiqat ）》（《突厥学报（Turkluk Bilgisi Araştirmalari）》第4卷，1980年，101～156页）、《古代维吾尔语佛教原始剧本〈弥勒会见记〉（哈密写本）研究》（《文史》第12辑，1981年，211～226页）、《哈密本回鹘文〈弥勒会见记〉第十六幕研究（Das 16. Kapitel der Hami-Version der Maitrisimit）》（《突厥学报（Turkluk Bilgisi Araştirmalari）》第9卷，1985年，71～132页）、《弥勒菩萨从兜率天降生——哈密本回鹘文〈弥勒会见记〉第十幕研究（Das Herabstieg des Bodhisattva Maitreya vom Tusita-Götteland zur Erde. Das. 10. Kapitel der Hami-Handschrift der Maitrisimit）》（《古代东方研究（Altorientalische Forschungen）》第14卷，1987年，350～376页）、《弥勒菩萨的显现——哈密本回鹘文〈弥勒会见记〉第十一幕研究（Das Erscheinen des Bodhisattva. Das. 11 Kapitel der Hami-Handschrift der Maitrisimit）》（《古代东方研究（Altorientalische Forschungen）》第15卷，1988年，315～366页）、《哈密本回鹘文〈弥勒会见记〉前五幕研究（Das Zusammentreffen mit Maitreya. Die ersten Fünf Kapitel der Maitrisimit）》（威斯巴登，1987年）、《古代回鹘语佛教启示录研究（Eine buddhistische Apokalypse）》（奥普拉登—威斯巴登，1998年），等。其中部分成果见刊于耿氏新近出版的《新疆文史论集》（中央民族大学出版社，2001年）和《维吾尔古代文献研究》（中央民族大学出版社，2003年）中，可以参见。

回鹘文研究专家李经纬对该写本的研究也投入了较大的精力，先后发表了《〈如来三十二吉相〉回鹘译文浅论》（《喀什师范学院学报》1981年第1期，47～56页）、《哈密本回鹘文〈弥勒三弥底经〉第二卷研究》（《民族语文研究论文集》，西宁：青海民族出版社，1982年，673～704页）、《哈密本回鹘文〈弥勒三弥底经〉第三卷研究》（《中亚学刊》第1辑，中华书局，1983年，180～211页）等一系列论文。