1926年·民国15年　1月21日，在沪参加释伽成道纪念会。随后赴武汉，讲经授归依而回。2月，先后至苏州、浙江西部地区、宁波，撰《居士士女学佛之程序》。春，与刘仁宣、熊希龄等发起创立全亚（后改中华）佛化教育社，社址在上海虹口，出版《心灯》旬刊。3月22日，在苏州江苏医科大学讲《身心之病及医药》。28日，于某居士林讲《法相唯识学概论》，先后又讲《楞伽大旨》、《唯识之净土》、《中国信愿行净土与日本教行信证真宗》。4月下旬，在杭州讲经、讲演。5月19日，在武汉讲经，后为武院学生讲《佛法大系》即经庐山回沪。夏，作《评宝明君〈中国佛教之现势〉》。提出中华之佛教，如能复兴也，必不在于真言或法相，而仍在乎禅。7月，至杭州讲经，作《建设人间净土论》。复应邀赴北京讲《四十二章经》，又讲《佛学概论》，提出缘起论为五乘共学，三法印为出世三乘共学，一相实印为大乘不共学的成熟判教。8月19日回沪，次日赴星洲（今新加坡）。9月，在星洲讲经讲学，并讲《祝南洋佛教之联合》，谈及南洋佛教联合会之筹设。与陈嘉庚、胡文虎晤谈甚洽。10月10日，国民革命军攻克武昌，武院停学。次日太虚启程回国。15日，经香港，游青山寺。18日，至厦门。21日，与厦门各界名人聚餐，有鲁迅、顾颉刚、陈定漠等。次日在厦门大学讲《缘起性空之宇宙观》。11月14日，于上海尚贤堂讲《化法应如何普及今世》。玉慧观归依。
　　1927年·民国16年　1月16日，在尚贤堂讲《佛之修学法》。约同时，作《僧制新论》。2月2日，上海“法苑”举行开幕式。该机构是太虚改革“经忏”，为佛教革新筹集经费的试点。3月，张宗载被捕，佛化新青年会解体。“法苑”在办“佛化婚礼”、祈祷息灾法会后维持艰难，宣告结束。太虚发表《以佛法解决现世困难》，号召各界护法。南普陀寺公举太虚为住持。4月，经福州小留至厦门。29日在南普陀寺升座，兼闽南佛学院院长。嗣为闽院学生讲《行为学与唯根论及唯身论》，回应西方行主为义心理学派。并先后发表《行为学与心理学》、《再论行为学与心理学》、《侯尔特（弗洛伊德）意识学与佛学》。5月初回沪。6月5日，作《说革命》。约同时，撰《以大同的道德教育造成世界和平》。夏，谢铸陈编《太虚法师文钞》初集由中华书局出版。7月，至杭州灵隐寺休夏。作《与竟无居士论作师》，编《佛法救世主义》。9月初，至奉化雪窦寺，为蒋介石及其家人讲《心经》。11日，返宁波。27日，在厦门主持闽院新学期开学典礼。嗣讲《救僧运动》。10月，游漳州南山寺，后回杭州。撰《真观实论·宗依编》。该书系回应现代各实证主义、人文主义学术流派，对坚定现代佛教徒的信仰具有重大意义。12月，著《自由史观》以及《评郭沫若论文化》、《论（韦尔斯）〈世界史纲〉》等多种，发表《告徒众书》。
　　1928年·民国17年　1月9日，一度来沪，旋回浙江崇德过春节。2月12日，武院著事会改组，太虚在家弟子王森甫任董事长。以27年冬，闽院发生学潮。约同时，太虚命大醒、芝峰先后去闽院主持教学。后数年，闽院成为太虚佛教教育事业之中心。春，住杭州灵隐寺。编《大乘宗地引论》，撰《生活与生死》、《论掌珍论之有为空量》，以评吕澄《印度佛教史略》、《因明纲要》。撰《再论唯识与法相》，以评欧阳渐《摄大乘论大意》。3月，发表《对于邰爽秋庙产兴学运动的修正》。4月21日，作《参考于中国佛教革命僧的训词》。23日，作《克鲁泡特金的人生善行学》。约同时，于之江大学讲《生命之研究》。春末，以神经痛在沪医治。5月3日，济南惨案发生，作《致日本佛教徒电》。同时在沪发起筹备“全国佛教徒代表会议”。于上海俭德储蓄会讲《人生的佛学》。6月23日，拜访蒋介石，以求组建全国统一的佛教团体。7月28日，在南京毗庐寺成立中国佛学会筹备处，发表《恭告全国僧僧文》。为护法多次撰文、请愿及与南京政府有关部门交涉。8月1日，在毗庐寺讲《佛陀学纲》。8月11日－1929年4月29日，经香港、越南西贡、星洲、锡兰（今斯里兰卡）科伦坡、埃及开罗（均作短时逗留）出访法国、英国、比利时、德国、美国弘法。在各国多有讲演，并联络各国东方学者、佛教徒筹备成立世界佛学苑。
　　1929年·民国18年　4月30日，于上海讲《去欧讲学及经过之一斑》。5月4日，出席上海各界限欢迎会，圆瑛致词。6日，赴杭州。12日，出席杭州佛教界欢迎会，讲《佛法对现代人类之贡献》。后至宁波。其间，对弟子大愚讲神通，谈宿命多所批评。6月3－5日，在沪出席中国佛教会第一次执、监委联席会议，被推为常委。对南京政府所拟《管理寺庙条例》表示不满，作“佛寺管理条例之建议”。7月，于灵隐寺度夏。19日，为王季同《佛法与科学》作跋。9月1日，在沪出席中佛会第二次执、监委会议。随后经苏州、镇江、九华山、安庆（皆有逗留）至武汉。29日，受到武汉各界盛大欢迎，讲《什么是佛学》，以教理行果统摄世界佛教佛学。10月1日，于汉口佛教会讲《法苑义林章唯识章》，李子宽归依。10日，于汉口文化学院讲《文化人与阿赖耶识》。后回武院，为研究生讲《大乘宗地图释》、《研究佛学之目的》。27日，指导汉口佛教会改组为佛教正信会。29日－11月12日，在长沙讲《什么是佛学》、《佛学与美术》等，并指导成立湖南省佛教会。11月29日，中国佛学会于南京万寿寺召开成立大会，太虚当选为会长，并函辞中国佛教会常委及学务委员长诸职，被挽留。12月，在宁讲《一切法因缘生唯识现》，访欧阳渐。后抵厦门南普陀寺闽院，讲《瑜伽真实义品》、《中国学僧现时应取之态度》。作《评（南京政府）〈监督寺庙条例〉》、《三宝歌》（弘一谱曲）。30日，于集美女中讲《佛学的人生观》。
　　1930年·民国19年　1月19日，编成《太虚大师环游记》。后至泉州、晋江，分别讲《从无我唯心的宇宙观到平等自由的人生观》、《佛教会是本慈悲心和智慧心所组成的》。自2月28日起，先后为闽院学众讲《大乘位与大乘各宗》、《佛学之宗旨及目的》、《僧佛教要建立在律仪之上》、《西洋哲学与印度哲学概观》、《建设现代中国僧制大纲》，后一文借鉴了西方神学院培养传统士的一些做法。复讲经等。4月8日，讲《纪念释迦牟尼佛》。后在厦门大学讲《佛学在今后人世之意义》，提出将佛教、基督教、伊斯兰教“三大系的文化，溶冶在一炉，使之铸成为全人类瑰玮灿烂的新文化。”在双十中学讲《民国与佛教》。在闽院并作短评多篇。11日，离厦回沪。后游天目山。5月，曾至杭州，回沪。11日，离沪赴北平（今北京）。20日，在北平华北佛教居士林讲《学佛的下手方便》，后又讲《国家观在宇宙观上的根据》、《人生的自由问题》及《华严经·普贤行愿品》。6月，与三时学会韩清净等游香山别墅。后游青岛，回沪。25日，在沪出席中佛会二届二次常务会议。后去宁波，游奉化雪窦寺。8月，游普陀山。9月，北平世界佛学苑柏林教理院成立，此为太虚构想中的世界佛学苑华英文系。13日，离沪真谛四川弘法。先后于重庆及其郊县讲佛学和《僧教育之宗旨》、《创造人间净土》等，发起筹备汉藏教理院；于遂宁讲《佛学之原理及其建立》，于成都讲《建设适应时代之中国佛教》等，于峨眉山讲《峨山僧自治刍议》，于嘉州（今乐山）讲《改善人心之渐教》，于叙府讲《佛教之新趋势及其修学方针》。12月，离重庆至汉口讲经。