1943年·民国32年　1月，于重庆钱业公会讲经。13日，重庆举行释迦世尊成佛纪念大会，太虚、虚云作开示。14日，与冯玉祥、于斌等一起出席中国宗教徒联谊会发起人会议。22日，抵荣昌宝城寺。24日，在荣昌各界欢迎会上讲《中国文化及佛教于战后欧州民族之关系》。2月10日回重庆。嗣于重庆罗汉寺每逢周六、周日公开答问。27日，欧阳渐逝世，太虚撰挽联悼念。是月，太虚筹备数年的重庆大雄中学开学，并兼该校董事长。3月21日，作《对于文艺政策之管见》、《中国民间之教化何在？》，批评新儒家之排斥佛教。22日，为国际大学教授吴晓铃《诸佛世尊如来菩萨尊者名称歌曲》作跋。5月22日，中国宗教徒联谊会成立，太虚任常务委员。春，在电台播讲《佛教与国民外交》，作《佛教之中国民族英雄史》、《阅〈为性空者辨〉》。夏，应张治中等约，赴某校夏令营讲《佛教哲学与青少年修养》。撰《中国今后之文化》、《联合国战胜后之平和世界》、《人群政制与佛教僧制》、《西藏问题之适当解决》。又讲《佛教徒应参与中国和世界的新文化建设》。8月30日，作《再议印度之佛教》。10月4日，《阅〈入中论〉记》脱稿。10月，在汉院讲《各人要在自己的岗位上努力》。秋，在汉院讲《中国佛学》、“贤首五教仪”。作《杂忆和杂感》、《阅〈东方杂志〉漫感》、《偶阅〈理想与文化〉的随感》、《感愚昧之害他自害》、《谈中印佛教之偶感》。11月，于复旦大学讲《中国之佛教》。视察大雄中学，题写校训“勤俭诚公”并略作开示。重庆国民政府内政部颁布《寺庙兴办公益慈善事业实施办法》，太虚召集中国佛学会理监事联席会议，通电反对。12月1日，抵桂林。4日，于广西佛教会讲《中国之佛教》。6日，抵衡阳。8日，于衡阳社会服务处讲《佛教与中国文化及世界和平》。14日，在南岳祝圣寺讲《佛法大意》。后又于水帘洞工校讲《工业文明之佛教》，于石头塔商校讲《缘起性空义》。在衡阳被推为花药山住持。21日，抵耒阳。23日，于耒阳民众剧场讲《佛教与人生》。对潮南省佛教工作作了指导，与各界代表一起决定组织“湖南僧侣救护队”。27日，于粤汉铁路大礼堂讲《佛教与人生》。30日，抵歧山仁瑞寺。
　　1944年·民国33年　1月2日，至书蒋介石，对国民党政府掠夺寺产深表悲愤，要求立即制止。3日，任仁瑞寺住持。9日，于衡阳社会服务处讲经。17－23日，于广西省佛教会讲经。25日回重庆。2月13日，为王普照《舍利佛塔秘行钞》作序。3月15日，访陈立夫等，商请汉院师生缓服兵役，全国僧侣免役专事救护。作《转移风气运动的原则》。后曾应中央文化委员会请，讲《佛学与文化》。5月14日，在缙云山欢迎印度大学校长罗达克利西那来访。6月，至国民政府司法行政部讲《佛法之内容及佛学理论之研究》。8月8日，在缙云山与陈铭枢等召开座谈会，研讨“佛法能否改善现实社会？”9日，患轻微脑溢血。9月，被国立敦煌研究所聘为设计委员。秋，编《人生佛教》一书，并在病中勉力为汉院学生讲其中的《代序》、《人生佛教之层次》。初冬，蒋介石游缙云山，并与太虚晤谈。后太虚离缙云山住重庆“太寓”。
　　1945年·民国34年　1月20日，在国际宗教联合研究会成立会上作演说。应国民外交协会请，致电美国罗斯福总统。春，西安大兴安寺巴利三藏院开学，太虚任院长。5月22日，出席宗教徒联谊会2周年纪念会，作《中国宗教徒联谊会赞词》。29日，回缙云山，指导汉院教职员分组研究西藏佛学、印度佛学、中国佛学、现代佛学并协调沟通。6月24日，英、美驻华大使访问缙云山，与太虚晤谈。7月4日，德国法西期无条件投降。因作《告日本四千万佛教徒》。5日，删补《自传》。8月15日，日本无条件投降。因作《告世界佛教徒》。9月，推荐法尊任汉院院长。14日，离缙云山。15日，于重庆北温泉举行（东南亚出访携归）佛教文物展览会。后曾于重庆中国佛学会会址讲《原子能与神通》。12月1日，汉藏教理际译场成立，太虚亲任场主，指导汉藏佛经互译。2日，为（英）蒲乐道《今日之中国佛教》作序。17日，国民政府内政部、社会部颁布训令：《依法组织中国佛教整理委员会》。太虚任该会常务委员，作《中国佛教会整理委员会之诞生》。是月，命法舫赴武汉，设法恢复世界佛学院图书馆。
　　1946年·民国35年　　1月10日，政治协商会议召开。因作《知识青年僧的出路》。13日，作复吴鼎昌书。是月，命又信携中国佛教整理委员会及中国佛学会文件先行赴南京。3月20日，赴汉口，于佛教正信会讲经。28日，抵南京，住中国佛教整理委员会会址毗庐寺。30日，于毗庐寺举行记者招待会，通报整理佛教计划。南京各界在毗庐寺举行盛大欢迎会，太虚讲《胜利归来话佛教》。5月6日，抵沪，上海各界聚集静安寺欢迎。7日，于是静安寺接见记者，谈及政治局势。是月，为《民国重修大藏经》作序，并于玉佛寺讲经。6月3日，至杭州。9日，杭州各界聚于灵隐寺欢迎，太虚略讲《佛法要义》。后返沪。7月15日，于上海筹备之《觉群周报》创刊，太虚任社长。约同时，在沪成立觉群社，以“问政而不干治”为该社会旨。李子宽在南京创立佛教文化社，太虚任该社董事长。28日，上海虹口西竺寺创立中国佛教医院，太虚任董事长。8月6日，抵镇江焦山。8日，在焦山主持中国佛教整理委员会僧材训练班毕业典礼。11日，镇江佛教界聚于金山寺欢迎，太虚讲《人生的佛教》。25日，上海佛教青年会成立，太虚出席成立会指导。9月1日，至函慈航。21日，至函《申报》，反对国民党上海市政当局强占寺院。是月，发表《集团的恶止善行》，呼吁重建道德。10月，抵南京，住中国佛教会会址普照寺讲经。17日，太虚发起在南京卧佛寺新创团体操大雄中学失火，处理善后颇感劳累。11月16日，中国佛学会在南京召开代表大会。25日，作《由经济理论说到僧寺经济建设》。12月7日，在南京监狱讲“佛是我们的善友”。9日回沪。25日，至宁波。30日，于宁波观宗寺讲《世出世间善法柁南颂》。
　　1947年·民国36年　1月3日，回奉化雪窦寺。后往宁波天童寺、阿育王寺访旧。在此期间，曾读《斯大林传》，对共产党员的体力与精神素质颇感叹。2月2日－4日，于宁波延庆寺讲《菩萨学处》。作《中国应努力世界文化》。在宁波期间曾作诗《奉奘（年）老》，为太虚最后诗篇。6日，至慈溪普济寺。后作《致摩诃菩提会书》、《佛教不要组政党》以及《呼吁美英苏倡导世界和平》、《国内和平的前途瞻望与中间调解》、《救西洋之乱即救世界之乱》。17日，因弟子福善之病，冒雪自宁波抵上海。3月5日，出席于玉佛寺召开的中国佛教整理委员会第七次常务会议。7日，在玉佛寺召见赵朴初等，赠以《人生佛教》一书，嘱各勉力。12日，为玉佛寺前住持震华封龛，书“封龛法语”，为太虚最后遗墨。忽脑溢血复发。宁沪杭甬间弟子闻讯皆来，多方医护。17日下午1时15分，太虚圆寂。时年59岁，法腊44秋。19日，善因主持行封龛礼。4月8日，自玉佛寺院至海潮寺行荼毗礼。10日，法尊等在海潮寺检得太虚法身所化舍利300余颗，心脏不坏，满缀舍利。5月25日，中国佛教会整理委员会、中国佛学会等团体在南京毗庐寺举行追悼大会，降重肃穆。全国各地也纷纷举行追悼会。